衣原體（Chalmydiae）是一類在真核細胞內專營寄生生活的微生物。研究發現這類微生物具有和革蘭氏十陰十性十細菌很多相似。這些特十性十是：（1）有DNA和RNA兩種類型的核酸；（2）具有獨特的發育周期，類似細菌的二分裂方式繁殖；（3）具有粘肽組成的細胞壁；（4）含有核糖體；（5）具有獨立的酶系統，能分解葡萄糖釋放CO2，有些還能合成葉酸鹽，但缺乏產生代謝能量的作用，必須依靠宿主細胞的代謝中間產物，因而表現嚴格的細胞內寄生；（6）對許多抗生素、磺胺敏十感，能抑制生長。1957年開始將衣原體分類於細菌類。
衣原體廣泛寄生於人、哺十乳十動物及禽類，僅少數致病。據抗原構造、包涵體的十性十質、對磺胺敏十感十性十等的不同，將衣原體屬分為沙眼衣原體（C.trachomatis）、鸚鵡熱衣原體(C.psittaci)肺炎衣原體(C.pneumonia)三個種（表18～1）。其中沙眼衣原體又有三個生物變種，即沙眼生物變種、十性十病淋巴肉十芽腫（LGV）生物變種和鼠生物變種。沙眼生物變種還有A～K14個血清型（包括Ba、Da、Ia）。LGV生物變種還有4個血清型，即L1、L2、L2a和L3。
表18-1 衣原體屬三個種的鑒別
| 十性十狀 | 沙眼衣原體 | 鸚鵡熱衣原體 | 肺炎衣原體 |
| 自然宿主 包涵體的形態 包涵體中的糖原 對磺胺敏十感十性十 對D-環絲氨酸的敏十感十性十 引起的主要疾病 | 人、小鼠 十卵十圓形、疏松 + + +++ 沙眼、包涵體結膜炎、十性十病淋巴肉十芽腫等泌尿生十殖道感染 | 禽類、哺十乳十動物 多種形態、致密 - - + 主要引起宿主感染，偶可由動物傳染給人，引起呼吸道感染 | 人 不規則、致密 - 青少年急十性十呼吸道感染，多見肺炎 |