腦
腦子分大腦、小腦二部，大腦主知覺，比如痛啦癢啦，一有刺激，它就能知道。
小腦主運動，比如手足的運動，身體的運轉，全是小腦的機能，大腦的位置在頭前，小腦的位置在頭後。小腦之下，緊接著就是延髓，在人之脖項後面。主管著呼吸及腦與脊髓之傳達作用，這是很重要的地方。延髓之下就接著脊髓，系在人之脊骨內包藏著。它能受腦的命令，運動全身，並能傳達全身的知覺，到瞭腦子裡，叫它知曉，所謂反射作用是也。人身上無有一處無神經系的，好比電線一樣，它的總機關，就是腦子、延髓、脊髓，所以這三種東西，是全身神經系的根本。
血液
血液是養人的要素，好比人是一個花草，血液就是它的汁水。若是有一枝一葉，汁水於瞭，這一枝一葉，馬上就要出毛病。若是全身的汁水幹瞭，這花草就會死的。人也是如此，所以血脈一不流通，馬上就不行啊！血之來源，是從吾人所飲食的東西造成的。因此欲講血之來源，不得不連同腸胃的生理，大概說一說。凡吾人當食物之時，必與口內之唾液混合，此液為亞爾加裡性作用，可變化淀粉質而為糖分。到瞭胃內，復有胃液作用，胃液的成份，為鹽酸與配普新。其中的鹽酸，能溶解蛋白質，變為配普新。（小腸之經過頗長，是為吸收之主部，且腸壁具有絨毛及皺壁。故收縮時能將乳糜等管壓迫，使乳糜向乳糜管內輸送，大腸亦有吸收機能。）凡食由胃入十二指腸，此時即有腸液、膵液、膽汁為消化作用。因唾液、胃液之作用，隻能化淀粉質及蛋白質，而不能化脂肪及其它物質，腸之粘膜及膵（胰腺的舊稱）分泌汁液，能破碎脂肪球為小分子。膽汁可化胃不能消化之物，且能使消化之物，變為透明體至腸內由粘膜之毛細血管吸收，漸漸匯集於門靜脈，入肝臟，造成血液。（肝臟能分泌膽汁，制造肝糖，又能提凈血液中之毒質，使已成乳糜佯之血液，化為赤色，而入於心臟。）肝為人身造血機關，凡食物由乳糜管集合入門脈，再由門脈入肝臟，再由肝臟毛細管，通過之際，受肝細胞作用（肝臟含有多量之鐵）即變為紅色血液。從肝靜脈至下大靜脈放流而至心臟。（肝臟能將食物化為潔凈之血液，故食物若含毒質，到此則能濾清將毒汁送回膽囊。）
由腸壁吸收之營養質，其輸送之道路有二：一由門脈經肝臟入大靜脈中以達於心臟；一經腸淋巴管，匯集於胸管，混入血液中，以達於心臟。（水鹽類糖分及蛋白質，由門脈輸送之，脂肪類則由腸淋巴管輸送之。）
血之周流全身，系由心臟左邊（左心室，發出來，先入大動脈。動脈血是鮮紅的，等著周遍全身，血的功用就乏瞭，好象已經燒殘的煤炭，火力是不中用瞭。此時的血已經到瞭極細的動脈毛細血管（乎足指尖，的尖端。由此尖端，就過入靜脈毛細血管中，漸漸往回流，又總匯到大靜脈血管。所以，靜脈血管又叫做回血管。此時的血，全成瞭暗紫色，即由此靜脈而回到心臟的右半邊內（右心房之內），這就叫做大循環。血既回到瞭心的右邊（右心房、，再由右邊出來，流到肺動脈血管裡頭去。此時血皆廢料，色皆暗紫。血既到瞭肺中，就利用肺的呼吸，呼出碳氣，吸入氧氣，自然把廢料排出去，又添上新料（氧氣）。又成瞭鮮紅的有用之血瞭，於是乎再由肺靜脈管，回到瞭心臟的左心房，再至左心室。而後再周流全身，這就叫做肺循環。（中醫書說營衛交會於手太陰肺，即是說的血由心臟至肺臟循環的道理，此種研究，中西競能相合，互證自明。）
心臟的機能，系左右收縮和開張，它能叫血液從一邊收進來，一邊噴出去，好象人握拳一樣，一緊一松，好象一個吸水筒，一邊吸，一邊噴。人之一生，一時也不能停止，若是心臟一停止，血就不流動，人也就死瞭。所以心臟是人全身的主宰，腦子神經雖靈；若是離瞭血之榮養，也是不中用的。
血的用處最大：1．可以滋養全身。2．可以發熱力，溫暖身體。3．可以抵抗病毒。4．凡人之一切生活現象，全仗著它的作用。血有赤血球、白血球，混合在一起。可是白血球可以自由出入於血管壁，所以身體無論何部，有瞭異狀，例如病菌侵入，白血球就去包圍它，與它抵抗，非把它排除去瞭不可，若是抵抗不瞭，白血球受瞭傷，那麼人也就覺著受不瞭病之纏繞瞭。中醫說血為營，氣為衛，營行脈中，衛行脈外，正是這個道理，可以細參。（血為營，不是說營就是血的代名詞，氣為衛，也不是說衛就是氣的代名詞。此二字乃指氣血以外之脂肪而言，因為此物在脈中脈外與氣血同行，有微妙的關系故也。）
皮膚
人身上第一層皮名表皮，這個表皮，無神經，刺之也不痛（俗稱油皮）。第二層名真皮，這個皮內有神經，有血管，所以刺之覺疼，破瞭就出血，又有汗腺，所以身上熱度太高瞭，它就出汗，排出廢物，可以放散體溫。又有皮脂腺，可以時常出油，保護皮膚，又有毛囊。
消化器
消化器可分為五部：1．口腔。2．咽喉。3．食道。4．胃。5．腸。茲將胃和腸的生理，大概說一說。
胃之上口名賁門，下口名幽門，幽門緊接著十二指腸。胃裡頭有一種液體，所以消化食物用的叫做胃液，是合百弗聖遊離鹽酸及水所成的。
腸之構造，和胃是一樣的，由三膜而成。其外層為漿液膜，中層為筋織膜，內層為粘膜。粘膜又有很多的絨毛和小腺，所以能吸收食物之精華，血液來源之第一步也。腸的上部名十二脂腸（近接胃之下口），再下則名小腸，再下則名大腸，（大腸和小腸接連的地方有一小突起，名曰盲腸。它的位置正當著吾人之右少腹下部，即右腸窩，所以盲腸痛最易診斷。又回腸、盲腸辦所以防食物逆流於小腸者。）再下則名直腸，再下則名肛門。
我們吃的東西，無論軟硬，皆在口內先嚼碎，和唾涎混合咽下。到瞭胃裡，胃液就分泌出來，胃筋也蠕動起來，兩三點鐘的工夫，就把食物消化成糜粥的樣子，然後由幽門送入十二指腸，再由十二脂腸到小腸。經過睜液、膽汁、腸液的化合，把糜粥樣的東西，化成乳糜，然後由腸內之粘膜吸收，分別運入乳糜管及淋巴管內（食物在小腸內吸收最多）。這時候消化不瞭的東西，就由小腸再下，經過盲腸辦，借著腸蠕動的力量，而入於大腸。食物在大腸內尚有一部分能吸收，此後再殘留下的渣滓，就完全成瞭廢料，水分也少瞭，漸漸的成為固質，由肛門排瀉出去，所謂糞便是也。
循環器
循環器即前講之血液，參看自明。
呼吸器
呼吸器人何以能呼吸，固然是呼吸神經的作用，然呼吸的器官，可不是隻依賴呼吸神經這一樣，所以肺，及肋間筋、橫膈膜，必須略講一講。
1．肺臟在人之胸間，由左右二部而成，包被於心臟。由大氣管而至氣管枝，愈分管愈細，到盡頭為盲管‘不透氣）。凡人之呼吸即借著胸廓的一張一弛，而肺．就活動起來瞭，吐故納新，與心臟的活動相輔而行。西醫說，成人一分鐘，凡呼吸十九次。中醫說，一呼一吸，謂之一息，是相合的。
2．肋間筋分內外兩層，它的生理，是彼此反對的。它的外層能將肋骨（俗名肋條骨）舉上，使胸廓擴大。內層能將肋骨牽下，使胸廓縮小。所以這樣一上一下才能讓肺臟容易活動，而營呼吸的工作。
3，橫膈膜橫亙於肺之下方，平時穹窿凸於上，若收縮時，則凹下，而增加胸廓之深。橫膈膜與肋間筋之一張一弛，是呼吸運動的一定之動作，它與肺之活動，有密切的關系。肺呼吸，也叫外呼吸，因身體內不斷的攝取空氣中之酸素，又不斷的將體內由酸化分解，所生之碳酸及水蒸氣，向空氣中排出，此機能叫做外呼吸。
組織呼吸也叫內呼吸，與外呼吸之氣體交換作用正相反。何以呢？因為人身上諸組織由血液中赤血球取出酸素，因此而起燃燒作用。消費酸素，發生碳酸，再送回於血液，這就叫內呼吸。因此而動脈血變為靜脈血，成瞭暗紫色。
皮膚呼吸，也叫作不感性呼吸，是由人周身上之皮膚（毛孔，排瀉少量之碳酸，且能攝取少量之酸素。但於發汗時，則其排瀉與攝取之量增加。（光緒三十三年，餘應陸軍部檢閱軍醫考試，論病者發熱惡寒之原理。餘曾以中醫肺主皮毛之說與此理互相闡明，是時中醫之有西醫知識者尚少，故得上考與五鎮正醫官陸叔丞君同列（九十五分）前茅，雖淺陋答案不足以質高明，然回憶當年，彌覺趣味橫生也。）
人體溫度，平均為攝氏表（檢溫器）三十六度半。脈搏，一分間（成年人）約七八十動，小孩較快。若按中醫說，脈是一息四、五至的為無病。若是太快，就是熱，太慢就是寒，若太無力，就是虛，有力就是實。（此應參看脈學。）
排瀉器
排瀉器將體內之廢物，放送於體外，就叫作排瀉。這一類器官，就叫作排瀉器。？
這一類的器官，約分三種，即1．肺臟，2．皮膚，3．泌尿器。一二兩項，前已說明，茲再略談談泌尿器，因為泌尿器是專營此排瀉的啊（消化器參照）。
泌尿器
分為腎臟、輸尿管、膀胱及尿道四部：
①腎臟 （俗稱腰子）腎臟系兩個，蠶豆狀，相對位於上部腰椎之左右兩側。它的凹部，叫作腎盂。腎內通過動脈和靜脈，好比一個濾鬥一樣。腎內有很多的細尿管，總歸二個大輸尿管，它能把人身上無用的水及血中的廢物，由此處濾出，送於輸尿管，而達於膀胱，再由尿道排瀉於體外，所謂尿是也。
②膀胱 膀胱有三口，其二口通左右二輸尿管，其一口通尿道。膀胱接尿道處，有括約肌環繞之，以資啟閉，而司排瀉尿液。中醫書謂膀胱有下口無上口，一由於缺乏解剖，二由於專講無形的氣化。雖然是錯誤，可是它那消息陰陽的道理，是極其微妙，不可不知。
神經系
神經系（已詳前論腦）
五官器
五官器分五種，略述於下：
1．觸覺器 皮膚內有神經，所以一觸外物，它就能報告給腦子，而能知其何如。
2．嗅覺器 鼻內粘膜有多數之嗅神經，所以外界香臭，一入鼻內，既能知之。
3．味覺器 舌內含有多數之舌咽神經，故食物入口，而能辨別其何味也。
4．視覺器 眼球內含視神經，故一遇外界之物映入，既能知之。眼球又有虹彩，能令昵孔散大或縮小。
5．聽覺器 耳之極深處，有聽神經，故外音送入鼓膜，就可以次傳到聽神經，而知之也。
生殖器
西醫講的生理，非常詳細，除以上諸器官外，尚有細胞、組織、骨骼、筋肉、腺、辦膜、體溫等重要生理，必須詳參。本篇限於篇幅，隻講大概，簡略太甚，不足以言醫學也。